El estudio longitudinal ELISA consiste en la realización de evaluaciones anuales del desarrollo de los niños y niñas participantes. La primera evaluación se realizó en la primavera de 2017, al inicio de la Educación Infantil, y la última hasta el momento, en la primavera de 2024, coincidiendo con el final de la Educación Primaria. El estudio ELISA pretende continuar el seguimiento durante la adolescencia de sus participantes, a lo largo de la Educación Secundaria.

El método principal de recogida de datos en el proyecto es el uso de cuestionarios, principalmente cumplimentados por las familias (madre, padre o cuidador/a principal). El uso de cuestionarios de tipo heteroinforme para madres/padres es una práctica necesaria para evaluar el comportamiento a edades tempranas, así como sus competencias psicosociales y de regulación emocional. Aun así, una vez que los niños y niñas adquieren la capacidad de informar sobre sus propios comportamientos y estados internos, es importante utilizar también cuestionarios de tipo autoinforme que permitan evaluar las variables psicológicas desde una perspectiva personal e idiosincrática. Por este motivo, en la fase final del proyecto se incluye a los propios niños/as en la evaluación.